除澄清其功能外，还应注意分子标记专利时还应注意什么？

上个月，我们谈到了在申请分子标记的专利时需要注意显式标记功能的需要（是否受到明确标记的功能，例如SNP或标签？）。今天，让我们看看除了阐明其功能外，还要看看哪些分子标记。

此案涉及一项具有2017103039365申请号的发明专利，名称为《快速筛选黄瓜有 / 无果瘤性状的显性分子标记》。该索赔要求保护分子标记物：

“ 1。一种主要的分子标记，快速筛选具有/没有水果肿瘤性状的黄瓜，其特征为：命名Y177，由序列清单中的Seq ID 1中显示的359个核苷酸组成。序列肿瘤品种包含这些359个核苷酸，以及水果肿瘤品种不包含这些359个核定菌的核苷。

SEQ ID 2中显示的上游底漆和SEQ ID 3号显示的下游底漆在上游底漆上放大了主要的分子标记Y177；

上游底漆来自黄瓜浆基因TU的启动子区域，下游底漆来自黄瓜浆基因TU的CDS区域。透明

在实际审查阶段，审查员认为比较文件1（CN102925434A）披露了与黄瓜植物基因TU共隔离的主要分子标记。权利要求1和比较文件1之间的差异是特征在于分子标记的特定序列不同。基于上述独特的技术特征，权利要求1实际上解决的技术问题是，提供了另一种不同的分子标记序列，用于筛选具有/没有性状的黄瓜的分子标记。鉴于上述独特的技术特征，比较文档1还揭示了可以根据水果肿瘤基因TU设计更多的主导分子标记物，以筛选黄瓜（除突变无毛和无肿瘤品种）类型的类型。也就是说，比较文件1还提供了一种设计方法，用于筛选黄瓜肿瘤/无肿瘤类型的显性分子标记。因此，当艺术中的熟练者需要设计一个新的分子标记物，以筛选具有/没有特质的黄瓜的新分子标记，根据上述比较文件1的披露，并与艺术中的共同技术知识结合在一起，就可以筛选和验证分子标记物的动机，并验证基于原始特征的新cucumber的分子标记，以适用于原始特征的新cucumber，以获取水果的特定特征，并使用果实的特定特征，并使用适用于水果的特征。通过有限的实验。因此，权利要求1不是创造性的。

拒绝专利申请后，申请人要求进行审查并修改索赔，并补充说“主张分子标记物Y177可以正确筛选有/没有水果肿瘤的黄瓜材料，在幼苗阶段缩短繁殖周期并加速黄瓜繁殖过程”。

申请人认为：尽管本应用中使用的基因和比较文件1是所有具有黄瓜性状的营养性肿瘤基因TU，但TU具有642个核苷酸序列，以及在此序列中可以用来在此序列中用作主要的分子标记的序列，需要通过研究获得。该应用中核苷酸的序列与比较文档1中显性分子标记的序列不同。在艺术中熟练的人不可能清楚地看到该应用中定义的主要分子标记序列Y177是否可以达到与比较文档1表达的分子标记和与比较文档1表达的分子标记以及是否可以与IT相同的分子标记与植物学共同的植物学素食。该应用确认Y177出现在各种水果肿瘤品种中，并且没有出现在非果肿瘤品种中，从而实现了意外的结果。 在比较文件1中未提及由本应用程序的引物靶向的区域。软件设计无法直接获得本应用程序的引物，也需要人工分析和选择才能获得； 该应用定义了分子标记物可以在幼苗阶段正确筛选带有水果肿瘤的黄瓜材料，并且比较文件1不能定义上述特征。可以使用哪种主要分子标记来区分种植黄瓜的哪个阶段具有水果肿瘤，只能通过探索和研究来知道。该应用的主要分子标记可以迅速筛选并在幼苗阶段鉴定无肿瘤/无肿瘤的黄瓜果实类型，并取得了重大进展。

关于上述意见，原始审查部认为：根据比较文件1，可以看出，无肿瘤的黄瓜品种没有DT-2中显示的主要分子标记。在艺术中熟练的人可以合理地期望，将靶向序列插入DT-2分子标记序列中的底漆对将无法获得特定的扩增片段，这反映了相应的分子标记序列的丢失。 根据普通的技术知识，艺术中的熟练者知道底漆设计中需要考虑的因素以及应满足的基本要求。即使在底漆筛查过程中有很多重复的劳动，它主要在协助验证中发挥作用，并且是必须参与底漆开发的常规技术手段。 当已知分子标记序列的组成时，其目的及其所带来的效果不会对分子标记本身产生限制效应。同时，在幼苗阶段，使用比较文件1中描述的分子标记物还可以正确筛选带有/没有水果肿瘤的黄瓜材料，缩短育种周期并加速黄瓜繁殖过程，可以正确期望，使用比较文件1中描述的分子标记物。因此，坚持原始的拒绝决定。

评论集团集团认为：

On the one hand, based on the results that the sequences of the markers DT-1 and DT-2 located in the CDS region of the pulp gene Tu disclosed in Comparative Document 1 exist in both tumor-containing cucumber varieties and are missing in the tumor-free cucumber varieties, after logical reasoning analysis, it is easy for those skilled in the art to know that other sections on the pulp gene Tu that choose to control the pulp tumor与DT-2重叠的特征仍然可以具有相同的作用，即区分黄瓜是否具有牙髓肿瘤性状，并与牙髓基因TU作为比较文档1中所述的主要分子标记物共隔离。另一方面，比较文档1在比较文档1中披露的黄瓜山雀属于单个基因占主导地位。在两个无肿瘤的黄瓜品种中都存在分子标记物DT-1和DT-2的序列DT-1和DT-2的序列。根据缺乏无肿瘤的黄瓜品种（除突变体无毛和无肿瘤的品种除外），艺术中熟练的人会很容易地认为，控制黄瓜山雀的整个黄瓜基因的CD区域，甚至是其上游调节区域，也可能缺少无肿瘤的肿瘤品种。可以通过有限的实验来验证这，并且从缺失区域选择的序列自然可以用作筛选黄瓜山雀的分子标记。此外，有几篇先前的艺术文章已经披露了与比较文件1相似的内容。那些在艺术中熟练的人都知道，可以鉴定出可以鉴定出黄瓜山雀的各种主要的分子标记，可以设计用于黄瓜山雀基因的不同区域。无论是在CD区域，启动子区域还是在两个区域中选择的分子标记，与黄瓜植物基因TU共隔离，并筛选黄瓜植物特征。 基于底漆设计软件，有限的筛选实验是一种常规的技术手段，必须参与底漆开发过程，并已成为技术人员的常规技能。这个过程不涉及创造性劳动。 比较文件1揭示了分子标记的一般功能，也就是说：“标签辅助选择与分子标志物与目标性状紧密相关的选择是一种非常有效的方法，这是分子遗传繁殖的一种非常有效的方法。分子标记是在dna水平上选择有限的范围，并且在环境中选择有限的阶段，并且在环境中选择了有限的阶段，并且在环境中选择了有限的阶段，并且是在环境中选择的优势。加速育种过程。”那些在艺术中熟练的人可以确定，使用比较文件1中描述的分子标记也可以在幼苗阶段正确筛选带有水果肿瘤的黄瓜材料，缩短育种周期，并加速黄瓜育种过程。因此，此功能的局限性无法为本应用带来创造力。

在回应上述意见的情况下，申请人认为：合作群体认为，只要通过包含DT2的部分序列获得的基因序列可以区分黄瓜是否具有或具有水果肿瘤性状不符合该领域的常规认知。比较文档1中DT2标签的位置1-93与本应用的分子标签Y177的位置相同，但是两者之间也有一些核苷酸序列。在控制Trochima基因的大序列中，某些序列可以用作筛选性状的分子标记，而某些序列无法筛选。仅通过移动控制黄瓜肿瘤性状的现有分子标记序列才能获得新的分子标记。不同的核苷酸序列可以表达不同的性状，甚至一个或多个基部的变化也会导致表达的不同特征。先前的ART不会披露与本应用的分子标记序列相同或相似的序列，也不会透露分子标记序列可以表达的特征。在此应用中鉴定出的Y177分子标记物是否表达与比较文件1的分子标记物DT-2相同的特征，并且不能预料的是，未预料分子标记是否可以使用黄瓜是否患有水果肿瘤，否则无法清楚地确定Y177分子标记物与分子标记DT-2相同的特征，无法清楚地确定Y177分子标记物是否表达了相同的性状。该应用确认Y177出现在所有有水果肿瘤的品种中，并且没有出现在没有水果肿瘤的品种中，从而实现了意外的结果。此外，该应用使用SSR42和SNP18来筛选纸浆肿瘤的基因。比较文件1使用SSR标记Y32和Y46。所选的单个基因基因座是不同的，最终选定的标记片段不同。不能预期SSR42和SNP18可用于筛选分子标记，以识别黄瓜是否具有。 不可能通过现有的常规设计规则获得稳定且高度特定的引物。研究人员需要创造性地选择适当的底漆设计位点，以有效地放大分子标记，以确定黄瓜是否具有水果肿瘤性状。本应用的分子标记物Y177的一端引物位于phoma Gene tu的启动子序列中，一端引物位于编码区域，而比较文件1位于编码区域。对于那些在艺术中熟练的人来说，使用启动子区域和TU基因的编码区域设计的底漆可以放大分子标记物，从而确定黄瓜是否具有肿瘤性状，这将是不明显的。 比较文件1仅记录了现有的分子标记物可以在幼苗阶段进行选择，并且没有专门记录如何在幼苗阶段筛选要筛选的分子标记，也没有记录哪些分子标记以识别黄瓜在幼苗阶段中是否具有果实肿瘤。那些在艺术中熟练的人不会清楚地考虑该应用中的Y177是否可以确定黄瓜在幼苗阶段是否患有水果肿瘤。同时，比较文件1还没有清楚地记录其分子标记是否可以用于幼苗鉴定。不同生长周期的影响，不同表达性状中包含的核苷酸序列也不同。需要通过探索和研究发现哪种主要分子标记以区分哪种种植阶段的黄瓜具有水果肿瘤。该应用的主要分子标记可以迅速筛选并在幼苗阶段鉴定无肿瘤/无肿瘤的黄瓜果实类型，并取得了重大进展。

在这方面，联合组织认为：

首先，比较文件1透露，无肿瘤的小象征品种完全缺乏浆中DT-1和DT-2的主要分子标记物的序列。本应用中描述的分子标记物Y177的267-359，比较文档1中TU的cDNA区域SEQ ID的1-254与Y177序列的SEQ ID 1号的106-359相同）。一方面，基于结果，标记物DT-1和DT-2位于比较文件1中披露的phodogen基因的CD区域中的序列存在于两个含肿瘤的黄瓜品种中，并且在无肿瘤的无肿瘤的象征性品种中缺失，并且在艺术中可以轻松地在逻辑上的序列中，该序列将在逻辑上的序列或新的序列进行分析，并将其定为新的分析。在比较文档1中披露的无肿瘤黄瓜品种中缺少的DT-2，新分子标记也表现为无肿瘤黄瓜品种中的缺失。 For example, on the basis of the DT-2 molecular marker, the 5’ end and the 3’ ends are moved and the other segments partially overlap with the sequence of the DT-2 molecular marker, specifically, for example, the 5’ end is located in the upstream regulatory region of the phodogen gene Tu, 3 The segment located in the CDS region of the pulp gene Tu, because the sequences belonging to DT2 contained in it are missing在无肿瘤的黄瓜品种中，调整后的新分子标记序列仍将显示在无肿瘤的黄瓜品种中。熟练于艺术的人被激励调整比较文件1中披露的分子标记以获得新的分子标记。根据比较文档1中披露的无肿瘤黄瓜品种，位于黄瓜基因TU的CDS区域的DT-2显性分子标记的序列可以完全缺少来控制黄瓜性状。很明显，控制黄瓜性状的分子标记序列可以在上游和下游移动，因此它们仍然包含DT-2中的某些序列仍然可以符合无肿瘤的无肿瘤黄瓜品种中缺少的新分子标记的特征。 In addition, from the perspective of primer amplification, since the comparison document 1 discloses that DT2 molecular markers are missing in tumor-free cucumber varieties, based on this, those skilled in the art can reasonably expect to use the sequence in the DT-2 molecular marker located in the CDS region of the pomelo gene Tu as the target sequence to design downstream primers, and use the promoter region of the pomelo gene TU作为设计通过设计上游底漆获得的底漆对的目标序列。由于下游引物没有可以特异性结合的靶标，因此新的底漆对将无法在Pomelo Cucumber品种中获得特定的扩增片段。结果反映出Pomelo Cucumber品种中缺少相应的分子标记序列，因此可以用作新的分子标记物来识别具有/没有性状的黄瓜。这是艺术中熟练的人可以合理地期望并进行常规调整的事情。也就是说，基于比较文件1中披露的内容，在艺术方面熟练的人可以合理地期望选择其他部分，以控制与DT-2重叠的Cucumber水果肿瘤性状，这些疗程与DT-2重叠，这些特征仍然可以与比较文档中描述的主要分子标记相同的效果，该效果与比较文档1的区分，并区分了cumber的毛茸茸的痕迹，该效果是否与cucumber的traite tarmber tarmber tar tarmistion rya”基因tu。 Moreover, selecting some sequences in the DT2 marker as a new molecular marker to identify tumors or tumor-free cucumbers does not need to worry about \”some sequences can be used as molecular markers to screen for this trait, and some sequences cannot be screened\”, because Comparative Document 1 discloses that the whole of DT2 molecular marker does not exist in tumor-free cucumber varieties.

另一方面，在比较文件1中披露的黄瓜山雀是单基因的主要特征。在两个无肿瘤的黄瓜品种中都存在分子标记物DT-1和DT-2的序列DT-1和DT-2的序列。根据缺乏无肿瘤的黄瓜品种（除突变体无毛和无肿瘤的品种除外），艺术中熟练的人会很容易地认为，控制黄瓜山雀的整个黄瓜基因的CD区域，甚至是其上游调节区域，也可能缺少无肿瘤的肿瘤品种。可以通过有限的实验来验证这，并且从缺失区域选择的序列片段自然可以用作筛选黄瓜山雀的分子标记。可以看出，比较文档1足以给出有关纸浆基因TU上其他分子标记物的发展的教学，这些分子标记具有部分重叠，这些重叠可用于鉴定基于比较文档1中鉴定的DT-2分子标记的具有/不具有纸浆性状的黄瓜。

那些在艺术中熟练的人知道，控制着金瓜果实特征的基因的Tu启动子区域和CD区域在无肿瘤的黄瓜中被完全删除，并且可以鉴定出可以鉴定出用于排除区域的黄瓜水果特征的各种显性分子标记物。无论是在CD区域，启动子区域还是在两个区域中选择的分子标记，与黄瓜植物基因TU共隔离，并筛选黄瓜植物特征。

关于底漆的设计，当确定靶基因的目标序列时，底漆设计已成为该领域的常规技能。该领域的人们意识到需要在底漆设计中考虑的因素以及应满足的基本要求，例如长度，GC内容，二次结构，底漆二聚体，3\’终端基本类型和TM值等。当前的引物设计软件已全面考虑了上述原理。即使不一定可用引物软件设计的底漆，底漆设计软件的基础也得到了有限的筛选实验，这是一种常规的技术手段，必须参与引物开发过程，并已成为现场人员的常规技能。这个过程不涉及创造性劳动。

对于分子标记是否可用于幼苗阶段鉴定，一方面，该应用与比较文件1相同。在示例中，在示例中，黄瓜品种的基因组DNA已知具有水果肿瘤但未验证水果肿瘤，并且尚不清楚是否使用了幼苗的幼苗cucumber阶段cucumber阶段。另一方面，如上所述，比较文件1已揭示了分子标记的功能：“标签辅助选择与分子标记与目标性状紧密相关的选择是一种非常有效的方法，这是分子遗传繁殖的一种非常有效的方法。分子标记是在不受限制地选择有限的情况下选择目标特征的优势，并且在环境中选择了有限的阶段，并且在环境中选择了有限的阶段。加速育种过程。”同时，熟练技术的人通常意识到DNA分子标记可以从植物体的任何部分提取DNA，尤其是从幼苗或种子中提取DNA，以早日鉴定和分析幼苗质量，克服了其他遗传标记物与环境条件或组织发育阶段不同的缺陷。也就是说，在艺术中众所周知，DNA分子标记不受环境条件或组织发育阶段的影响。这些条件仅影响基因的表达，但不能改变基因组DNA的核苷酸序列。总而言之，基于比较文件1和艺术中的常识的内容，在幼苗阶段，使用比较文件1中描述的DNA分子标记物可以筛选带有/没有水果肿瘤的黄瓜材料的DNA分子标记，并缩短育种周期，并加速黄瓜繁殖过程。因此，此功能的局限性无法为本应用带来创造力。

因此，申请人的原因无效。

合作组织终于做出了审查决定，以维护原始的拒绝决定。

The key to this case is that the function and sequence of the gene Tu that controls the traits of cucumber nuts are known, and those skilled in the art have known that the Tu promoter region and CDS region of the gene that controls the traits of cucumber nuts are completely deleted in tumor-free cucumbers, and a variety of dominant molecular markers that can identify the traits of cucumber nuts can be designed for the缺失区域。无论是在CD区域，启动子区域还是在两个区域中选择的分子标记，与黄瓜植物基因TU共隔离，并筛选黄瓜植物特征。

在这种情况下，专门设计的引物和分子标记物可以实现的功能（技术效应）是由技术人员所期望的，因此本发明声称的分子标记物并非有创造力。

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